埃及保護了它將近10%的海洋,而它的海洋保護區(MPAs)也贏得了良好的聲譽。然而,一份報告顯示,管理資源和資金的缺乏,以及一些衝擊性的問題,正在威脅已有的成果。大多數的埃及海洋保護區資源都不足,遠遠低於發展中國家甚至非洲的標準。一般鹹認有效管理的主要限制是政府補助的層級過低,職員人數少於需要的人數,以及資金和職員的分配差距。管理資源不足和基礎設施貧乏也是重要的制約因素。此外,各個MPA的收入集中到NCS的中央基金,補貼那些在整個埃及優先網路中不會創造資金的其他保護區。(紅海的)五個海洋保護區可以透過旅遊收入支撐它們自己,但是它們所創造的資金再投資于每一個海洋保護區的不足10%。例如,拉斯穆罕默德海洋公園(Ras Mohammed Marine Park) 2004-2005年度創造了1,538,752歐元的財源,但其中再投資園區的只有156,060歐元。